1991年的香港,黑帮势力暗潮涌动,一场足以撼动江湖的巨变悄然拉开帷幕。黑帮龙头倪坤意外被杀,倪氏家族旗下的五大头目中,除韩琛(曾志伟饰)外,其余人皆蠢蠢欲动,妄图背叛倪家,瓜分利益。然而,倪家看似不起眼的第二代倪永孝(吴镇宇饰)却展现出惊人的智谋与手段,不费一兵一卒便将这场潜在的叛乱轻松化解,成功稳住了倪家的局势。
倪永孝的这一系列举动,引起了重案组督察黄志诚(黄秋生饰)的高度警惕。为了深入掌握倪家的犯罪证据,黄志诚精心策划,派出警校学生陈永仁(余文乐饰)以卧底身份潜入倪家,开启了一段漫长而危险的卧底生涯。与此同时,韩琛为了进一步巩固自己的势力,早在警察内部安插了线人刘建明(陈冠希饰)。至此,一场正邪之间的暗战,在隐秘的角落悄然打响。
时光飞逝,三年后,倪永孝的事业蒸蒸日上,势力范围不断扩大。为了彻底消除潜在的威胁,他决定对五大头目展开清算,企图一举将其歼灭。然而,百密一疏,韩琛在这场血腥的清洗中侥幸逃脱,成为漏网之鱼。
1997年,大难不死的韩琛重出江湖,满心仇恨的他一心想要为死去的同事报仇。黄志诚找到韩琛,提出与他合作除掉倪永孝的计划。但令他们万万没想到的是,这一决定却引发了一系列难以预料的后果,让局势变得更加错综复杂。
在这场正邪对抗的漩涡中,陈永仁和刘建明这两个身负特殊使命的年轻人,各自为自己的尴尬身份而苦恼挣扎。陈永仁在倪家小心翼翼地周旋,每一步都如履薄冰,时刻担心身份暴露;刘建明则在警察内部隐藏着自己的真实面目,内心承受着巨大的压力。他们仿佛置身于无间地狱,在正义与邪恶的边缘徘徊,在无间道的道路上越行越远,而这场惊心动魄的黑白较量,也仍在继续……